1：结构不同:摇臂钻床的主轴箱装置在摇臂上，摇臂装置在立柱上，摇臂可在立柱上面上下移动，摇臂可以旋转360度，主轴箱可以在摇臂上做大规模移动，很容易把主轴的中心对准要加工的工件。在钻削大型和重型的多孔工件时，就可以免除搬移工件，而直接移动摇臂和主轴箱进行加工，大大提高了工作效率。
立式钻床的主轴箱固定在床身顶部，主轴不能前后左右的移动，只适宜在工件上加工单一的孔，在比较大的工件上钻削很多孔时，当钻完一个孔，再钻另一个孔时，就必须要移动工件，才能继续钻孔。:
2：钻孔深度不同：摇臂钻床钻孔深度有限，立式钻床则较深， 立式钻床刚性优于摇臂钻，螺纹加工时候立钻的优势也比摇臂钻床明显。
3：利用率不同：摇臂钻结构使得该款机床可以自由旋转，加工面积较大，比较灵活多面，加工的零件种类和加工范围较大。立式钻床受制于结构，不能大范围加工工件，主要适合在小工件多孔加工或者深孔加工 。
4：立式钻床的稳定性要优于摇臂钻床。